Digitale certificaten hebben verschillende toepassingsdomeinen welke hieronder worden behandeld. 

• Authenticatie
  Hier wordt aan de hand van het digitaal certificaat de toegang tot het privaat luik (intranet, extranet) van uw site geregeld. Ook wordt hier soms gesproken van een E-loket toepassing. Uiteraard is dit een stuk veiliger dan de klassieke controle op basis van User-id en Paswoord.
   
• Encryptie
  Een tweede toepassing is het versleutelen (encrypteren) van documenten en E-mail. Bedoeling is dat deze digitale communicatie, bij eventuele onderschepping door derden, onleesbaar wordt en dus enkel door de bestemmeling kan worden gelezen.
   
• Digitale handtekening.
  Een derde toepassingsdomein is het digitaal ondertekenen van elektronische documenten . We denken hierbij in eerste instantie aan zakelijke documenten zoals contracten, financiële transacties maar ook toepassingen in contacten met de overheid zowel zakelijk als privé kunnen op deze manier verlopen.